同源克隆过程简介

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同源克隆简介
一、    材料准备和冷诱导    2
二、    RNA提取和反转录    2
三、    PCR扩增基因中间片段和回收    2
四、    体外连接和转化    3
五、    菌落筛选和测序    3
六、    序列分析和race引物设计    3
七、    race法获取基因的3’和5’末端    4
八、    基因全长拼接和生物信息学分析    4

同源克隆简介
一、 材料准备和冷诱导
1. 材料培养
2. 材料冷诱导
二、 RNA提取和反转录
1.  RNA提取准备(参考文件夹RNA提取相关知识)
2.  RNA提取过程(参考文件夹RNA提取过程)
3. RNA反转录为cDNA
a)         RNA      5ul/8ul
体系    oligodT  1ul
15ul    RNaseFree-ddH2补足15ul
b) 70 For  5 min
c) 冰预 For  5 min
印尼d) 加入      5×buffer  5ul
dNTP      1.25ul
体系      RRI        1ul
M-MLVR    1ul
RNaseFree-ddH2高中语文教学大纲O  1.75ul
e) 42  For  1h
三、 PCR扩增基因中间片段和回收
1. 同源引物设计
理解如何进行设计,并学着去同源引物设计(参考生物信息学材料)
2. PCR体系(25ul)
      cDNA模板    2.5ul
      ddH2O        17.2ul
      Buffer        2.5ul
      Taq        0.4ul有效教学研究
dNTP          0.4ul
引物        上下游各1ul,2ul(参考抗寒基因引物文件夹)
3. 反应程序

1) 94 for  5min
2) 94 for  30s
3) 45-58 for  45s
4) 72何处寻真相 for  1min
5) Go to  2 ,  5 times
6) 94 for  30s
7) 55 for  45s
8) 72 for  1min王牌拖拉机
9) Go to  6,  30times
10) 72 for  10min
11) 16 for  ever
12) end

其中反应体系和程序可根据实际情况进行改变,注意理解每一步的原由。

4. 电泳检测
理解琼脂糖凝胶电泳全过程及相关注意事项(查阅资料)
营造地表形态的力量5. 切胶回收
参考DP209--离心柱型--普通Dpdf文件)
四、 体外连接和转化
1. 体外连接
参考pGM-T克隆试剂盒
2. 转化
1) 准备工作
a  LB培养基配制  b 感受态细胞制备
2) 转化过程
参考pGM-T克隆试剂盒
五、 菌落筛选和测序
1. 利用а互补作用进行蓝白斑筛选,从转化的平板中挑去白斑画线扩大培养;
2. 选择画的好的线,进行菌落PCR,过程同普通PCR ,只是把原来的模板换作ddH2O
3. 选择PCR出条带的线条进行摇菌,送公司进行测序。
六、 序列分析和race引物设计
利用DNAMANPrimer5.0 以及NCBI网站进行序列分析和RACE引物设计
七、 race法获取基因的3’和5’末端
        RACE法获取cDNA 两端(查阅资料)
八、 基因全长拼接和生物信息学分析
race 法获得两段片段之后,将整个基因整合在一起,所得序列进行Blastn验证和序列结构分析。

本文发布于:2023-08-15 11:30:53,感谢您对本站的认可!

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