只需三步micRNA定量引物设计法(加尾法)

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只需三步micRNA定量引物设计法(加尾法)
引物设计应该是科研汪都需要掌握的⼀项基本技能吧,我们在之前讲过如何现成拿验证过的PCR引物,也有涉及到如何做进⼀步的引物修饰,那么如何对MicroRNA进⾏引物设计呢,作为20世纪最⽕的科研对象之⼀,本引物设计你不能不回啊。
MicroRNA⼀般由20多个碱基组成,引物位置基本固定。下⾯给⼤家介绍简单的加尾法,只需设计正向引物,反向引物试剂盒⾃带。
水产学报另外还有茎环法,⽅法复杂,暂时不做介绍。
第⼀步转换序列,将原始序列中的U全部转化为T
ATGCGTAGCTTCGTACGTAGCTGT
(原始序列为:AUGCGUAGCUUCGUACGUAGCUGU)
第⼆步打开链接轻兵器俱乐部
将以上转化后的序列按下列⽅式输⼊,点击Submit
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出现以下页⾯,⾸先检验Tm值,62.2度,温度稍微⾼了些。GC含量正常。
第三步修改
既然Tm值偏⾼,我们可以减少⼏个碱基,减少最后4个碱基(碱基只能去掉头或者尾,⾄于去掉⼏个,⼀般在保留19个以上碱基的情况下来确定,在此基础上保证GC含量和Tm值尽量满⾜要求。
以下,去掉4个尾部碱基,其他条件基本符合。
注意:⾸先得保证长度,不能太短。
作者琳琳猫----
⼀个会烹饪会写古⽂的耿直⼥⼦,浙江⼤学⾷品⼯程学硕⼠,曾就职于华⼤基因7年。有丰富的snp,甲基化,rna检测等⽅法学研究经验。彩视错觉
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本文发布于:2023-08-15 11:05:38,感谢您对本站的认可!

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