生物信息学在农业领域的应用及展望

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安徽农学通报,Anhui Agri ,Sci ,Bull ,2019,25(22)
作者简介:徐佳莹(1995—),女,山东人,在读研究生,研究方向:农业信息化,信息技术应用与推广。
*通讯作者
收稿日期:2019-09-19
生物信息学在农业领域的应用及展望
徐佳莹1宁
璐2*
(1北京农学院计算机与信息工程学院,北京
102206;2北京农学院图书馆,北京
102206)刘士豪
东方红汽车
摘要:该文阐述了生物信息学在农业领域如农业数据的挖掘与利用等方面的具体应用,对生物信息学在其
他领域的发展进行了展望,并提出了今后发展的几点建议。关键词:生物信息学;数据库;农业应用中图分类号G642.0
文献标识码A
文章编号1007-7731(2019)22-0125-03
Research and Prospect of Bioinformatics in Agriculture
Xu Jiaying 1et al.
(1School of Computer and Information Engineering ,Beijing University of Agriculture ,Beijing 102206,China )Abstract :The article mainly expounds the specific application of bioinformatics in the field of agriculture ,such as the mining and utilization of agricultural data ,and draws on the development experience of bioinformatics in other fields ,and puts forward relevant development suggestions.Key words :Bioinformatics ;Database ;Agricultural application 生物信息学一词的由来,最早是在1956年首次召开的“生命科学中的信息理论讨论会”上被提出的,之后随着基因组计划的
提出和现代生物技术的飞速发展,不断持续增长的生物信息量成为了阻碍传统研究的最大问题。因此,以分子生物学为基础,与计算机技术、数学等学科结合产生的交叉学科——生物信息学应运而生,并逐渐发展成为了最具潜力的学科之一,现已经涉及到生物科学的各个方面。英国首例死亡病例
农业生产的发展同样离不开生物科学的发展,将生物信息学的相关技术渗透到农业生产发展当中,对进一步推动我国农业现代化的发展进程具有重要的意义。目前,对于生物信息学硬件设施的建设经基本趋于完善,但在生物信息数据分析方面还存在一定的差距。利用计算机对数据的处理能力,并结合在生物学等方面的研究数据,能够便捷的实现对这些数据的获取与存储、组织与分析以及检索与可视化,这使得生物信息学在农业领域能更充分地发挥其优势作用。因此,在未来农业发展的过程中,生物信息学势必会对其产生深远的影响。
1生物信息学在农业上的研究应用
1.1
农业数据的挖掘与利用
随着农业耕种措施的改
变,数字农业的发展必将成为主要的发展方向。农业生物信息数据库的使用,可以实现农业数据的录
入导出、检索分析等基本数据处理的功能,便于使用者能够快速地从大量的数据中提取到有用的信息。数据库作为存放数据的存储器,是进行信息处理的基础,位于开展各项工作
的起始位置,可以进行数据的整理与存储。例如,在对国际大豆基因组测序计划的过程中,研究人员建立了完整的大豆转座子数据库和相关网站,为用户提供浏览查、搜索下载等功能,这些功能为研究人员在对豆科植物基因组的注释、基因功能、基因组进化以及分子育种等方面的研究提供了极大的帮助。农业生物信息数据库的应用,能够实现对农业生产研究当中的数据录入查询并能进行统计计算等基本功能;通过对农业数据的挖掘与利用,再从这些数据当中高效地提取出有效的数据信息,通过对农作物基因组的识别与新基因组的发现,利用生物信息学相关工具,就可能实现对农作物品种的改良和丰富种质资源数量等,从而满足科学研究和人类生活等方面的基本需求[1]。1.2
农业模式植物方面的研究
H无穷不确定系统鲁棒稳定
模式植物是指一种植物dna探针
的特征明显并且可以很容易与其他植物区别开的植物,一般都从命名植物学家所采集的标本为准。目前,世界上已经被命名的任何一种植物都有其模式植物[2]。农业模式植物就是在农业生产和利用上特征明显、常用来可以区分其他植物的特征植物。1997年5月,美国开展了国家植物基因计划,在该计划实施的背景下,各国科学家通力合作经过多年的努力,使得植物基因组的研究取得了重大进展,
实现了对某些模式植物的全基因组测序。在此基础上,从基因组的角度进一步分析和研究了传统农作物的基因表达以及蛋白质和核酸的定位等问题,在分子水平上掌握了这些植物的细胞结构与功能。由此可
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>教师教育研究

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标签:农业   生物   研究   植物   信息学   数据
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