蛋白质数据库

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生物芯片北京国家工程研究中心
湖南中药现代化药物筛选分中心
暨湖南涵春生物有限公司
常用数据库名录
1、蛋白质数据库
PPI - JCB 蛋白质与蛋白质相互作用网络
Swiss-Prot - 蛋白质序列注释数据库
Kabat - 免疫蛋白质序列数据库
PMD - 蛋白质突变数据库
InterPro - 蛋白质结构域和功能位点
PROSITE - 蛋白质位点和模型
BLOCKS - 生物序列分析数据库
Pfam - 蛋白质家族数据库 [镜像: St. Louis (USA), Sanger Institute, UK, Karolinska Institutet (Sweden)]
PRINTS - 蛋白质 Motif 数据库
ProDom - 蛋白质结构域数据库 (自动产生)
PROTOMAP - Swiss-Prot蛋白质自动分类系统
SBASE - SBASE 结构域预测数据库
SMART - 模式结构研究工具
STRING - 相互作用的蛋白质和基因的研究工具
TIGRFAMs - TIGR 蛋白质家族数据库
BIND - 生物分子相互作用数据库
DIP - 蛋白质相互作用数据库
MINT - 分子相互作用数据库
HPRD - 人类蛋白质查询数据库
IntAct - EBI 蛋白质相互作用数据库
GRID - 相互作用综合数据库
PPI - JCB 蛋白质与蛋白质相互作用网络
2、蛋白质三级结构数据库
PDB - 蛋白质数据银行
BioMagResBank - 蛋白质、氨基酸和核苷酸的核磁共振数据库
SWISS-MODEL Repository - 自动产生蛋白质模型的数据库
ModBase - 蛋白质结构模型数据库
CATH - 蛋白质结构分类数据库
SCOP - 蛋白质结构分类 [镜像: USA | Israel | Singapore | Australia]
Molecules To Go - PDB数据库查询
BMM Domain Server - 生物分子模型数据库
ReLiBase - 受体/配体复合物数据库 [镜像: USA]
TOPS - 蛋白质拓扑图
CCDC - 剑桥晶体数据中心 (剑桥结构数据库 (CSD))
HSSP - 蛋白质二级结构数据库
MutaProt - PDB数据库中点突变的比较
SWISS-3DIMAGE - 蛋白质和其他生物分子的三维图像
BioImage - 生物图像数据库 (包含生物大分子图像)
3、蛋白质组数据库和链接
2-D胶数据库以及与2-D胶相关的数据库
蛋白质组链接
4、与核酸相关的数据库
EMBL - EMBL核酸序列数据库 (EBI)
Genbank - GenBank核酸序列数据库 (NCBI)
DDBJ - 日本DNA数据库
dbEST - dbEST(表达序列标签)数据库 (NCBI)
dbSTS - dbSTS(序列标签位点)数据库 (NCBI)
AsDb - 异常剪切数据库
ACUTS - DNA非转录保守序列数据库
密码子数据库
EPD - 真核生物启动子数据库
HOVERGEN - 颈椎动物同源基因数据库
IMGT - 免疫遗传学数据库 [镜像: EBI]
ISIS - 内含子序列信息
RDP - 核糖体数据库
gRNAs db - gRNA数据库
PLACE - 植物DNA顺势调控元件数据库
PlantCARE - 植物中DNA顺势调控组件数据库
ssu rRNA - 欧洲核糖体RNA数据库-小核糖体
lsu rRNA - 欧洲核糖体RNA数据库-大核糖体
5S rRNA - 5S核糖体RNA数据库
tmRNA Website - tmRNA站点
tmRDB - tmRNA数据库
tRNA - tRNA剪切( Bayreuth大学)
uRNA db
RNA editing - RNA剪切位点
RNAmod db - RNA修饰数据库

本文发布于:2023-05-07 13:56:08,感谢您对本站的认可!

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标签:数据库   蛋白质   生物   序列   结构
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