DNA甲基化检测技术

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·综  述
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DNA甲基化检测技术
智能游戏者甘薯苗杨林林1,蒋 涛2,隋亚鑫1,史文杰2,宋永波3,田亚平2,张朋军1
(1.北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所介入科,恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室,北京100142;
2.中国人民解放军总医院转化医学实验室,北京100853;3.沈阳药科大学医疗器械学院,辽宁沈阳110016)
DOI:10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2020.05.038
龙虾地笼
收稿日期:2019 12 24;修回日期:2020 03 12
基金项目:北京市科技计划 首都健康保障培育研究(编号:Z181100001618015);国家重点研发计划(编号:
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2016YFC0106604);国家自然科学基金青年科学基金(编号:81502591)
通讯作者:张朋军,副研究员/副教授。E mail:zhangpj301@126.com摘要:真核细胞的DNA具有独特的基因组甲基化模式,它作为一个分子开关来控制细胞的转录机制,参与癌症等疾病的发生发展过程。不断发展的甲基化检测技术为DNA甲基化变化对癌症进展的影响提供了更好的理解。在本文中,主要讨论了近年来发展的几种常见DNA甲基化检测方法,对MSP、MethyLight、digitalMSP、核酸质谱、甲基化芯片、测序(一代测序、二代测序和三代测序)方法进行解读与比较,并展望未来检测技术的挑战与发展。
关键词:DNA甲基化; PCR; 数字PCR; 核酸质谱; 测序
中图分类号:Q753  文献标识码:A
DNAMethylationDetectionTechnology
YANGLinlin1,JIANGTao2,SUIYaxin1,SHIWenjie2,SONGYongbo3,
TIANYaping2,ZHANGPengjun
1(1.InterventionalDepartment,PekingUniversityCancerHospitalandBeijingCancerPreventionandTreatmentInstitute,KeyLaboratoryof
PathogenesisandTranslationalResearchofMalignantTumors,MinistryofEducation,Beijing100142,China;2.Laboratoryof
TranslationalMedicine,PLAGeneralHospital,Beijing100853,China;3.SchoolofMedicalEquipment,Shenyang
PharmaceuticalUniversity,Shenyang110016,China)
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Abstract:DNAofeukaryoticcellshasauniquegenomicmethylationpattern,whichactsasamolecularswitchtocontrolcells'transcriptionmechanismandparticipatesinthedevelopmentofcancerandother
diseases.EvolvingmethylationdetectiontechnologiesprovidepossibilitiestobetterunderstandtheimpactofDNAmethylationpatternchangesoncancerprogression.Inthisarticle,severalcommonlyusedDNAmethylationdetectionmethodsdevelopedinrecentyears,includingMSP,MethyLight,digitalMSP,nucleicacidmassspectrometry,methylationchips,sequencing(first generationsequencing,second generationsequencingandthird generationsequencing),arefullydiscussedandcompared,andwealsolookforwardtothepotentialchallengesanddevelopmentoffuturedetectiontechnologies.
Keywords:DNAmethylation; PCR; DigitalPCR; Nucleicacidmassspectrometry; Sequencing  1 DNA的甲基化与癌症
  DNA贮存了生物的大多数的遗传信息,DNA是
由四种不同的碱基(A、T、C、G)、核糖、磷酸碱基等构
成,化学修饰可以发生在碱基上,其中最常见的化学
修饰就是DNA的甲基化。DNA甲基化是一种表观遗传机制的现象,它发生在高等真核生物基因组的CpG二核苷酸中,通过DNA甲基转移酶来催化添加一个甲基基团去修饰5 C 磷酸酯 G 3(CpG)核苷酸残基上的胞嘧啶[1 5]来实现,多发生在富含鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)的序列即CpG岛上。脊椎动物的898LabeledImmunoassays&ClinMed,May.2020,Vol.27,No.5

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