2022年SARS CoV 2欧米克隆变种的特征和预防（全文） dr探测器1. COVID - 19大流行已经持续了近两年
灰度矩阵
据世界卫生组织统计，全球已报告确诊病例2.6亿多例，其中500多万人死亡。2019年底发现的最初的严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS CoV 2)已经进化并出现了多种变体。为了优先监测和研究这些变异，世卫组织将它们分为三类:关注变异VOCs、关注变异VOIs和监测变异VUMs。前4种VOCs分别为Alpha (B.1.1.7)、Beta (B.1.351)、Gamma (P.1)和Delta (B.1.617.2)。它们都导致了一波新的大流行，在不止一个国家和地区，甚至在全世界造成数千人死亡。2021年11月26日，世卫组织将一种名为Omicron (B.1.1.529)的新变种指定为第五种VOCs，立即引起全球关注。 回程间隙
2. 从第一个Omicron变异发现，到出现在其他大陆
根据世卫组织的报告，已知的经OMICRON确认的感染可追溯到2021年11月9日采集的一份样本。然而，可获得的第一个Omicron序列来自于2021年11月11日在博茨瓦纳采集的一个样本。自从欧米克隆被发现以来，这种变种似乎迅速传播开来。最近对11月12日至20日在南非
auts豪登省采集的77个病毒样本的基因组序列分析表明，所有分析的变种实际上都是B.1.1.529, 这表明Omicron在豪登省正成为优势。此外，欧米克隆的发现与南非最近新冠肺炎确诊病例的急剧增加相吻合。
在Omicron变种被证实后，平均每天的新冠肺炎病例数从280例增加到800例。该数字在2021年11月26日突破2000人，在2021年12月3日突破1万人。此外，追踪COVID - 19病例的来源显示，在南部非洲发现第一批病例之前，B.1.1.529变体可能已在西欧传播。在收到报告的当天，世卫组织将其指定为VUM，并将其命名为Omicron变体(B.1.1.529)。仅2天后，WHO将Omicron变种归类为VOC，记录了从VUM到VOC重新归类的较短间隔时间，引起公众极大关注。在非洲发现Omicron后几天，该变种就出现在其他大陆。
视频显示器 很明显，这种变体并没有停止向其他国家和地区传播。欧米克隆变种在哪里以及如何进化还有待研究。对SARS冠状病毒变异株的序列分析表明，Omicron与其他SARS冠状病毒变异株有很大的不同，很难识别其最近的亲缘关系。系统发育研究的结果表明，Omicron变体可能早于其他SARS CoV 2变体，而不是由以前的VOCs发展而来。据推测，Omicron变体可能是在免疫缺陷个体(例如，HIV患者合并感染SARS CoV 2)中孕育了一段时间，或者它可能在非人类物种中进化，最近才扩散回人类。
3. 南非三次COVID - 19大暴发
自2020年初以来，在南非记录了三次COVID - 19大暴发浪潮(图1A)。其中2个分别是Beta和Delta变异引起的(图1B)。流行病学数据显示，在其爆发后约100天内，与Beta变种相关的感染百分比增加到每日总感染的50%(图2)。然而，在同一时期，Delta变种的感染百分比上升到80%。与Beta型相比，Delta型在人中的传播率更高。相比之下，在南非，Omicron感染的百分比在大约25天内达到了90%(图2)。Beta、Delta和Omicron变异的早期倍增时间分别为1.7、1.5和1.2天。这些数据表明，Omicron变种可能比Delta和Beta变种更具传染性。同样值得注意的是，最近南非人口广泛的流行病学资料表明，SARS再感染的风险增加。新一波的COVID 19已从南非流向世界。
对Omicron变异的基因组序列分析发现了大量的非同义突变，包括几个已被证明与传播性、疾病严重程度和免疫逃逸有关的穗状突变。总的来说，在Omicron变体中已经确定了60多个替换/删除/插入，其中12个使得Omicron变体成为迄今为止所确定的所有SARS CoV 2变体中拥有最多突变位点的变体。在ORF1a中，Omicron变种含有6个取代基(K856R, L2084I, A2710T, T3255I, P3395H和I3758V)，以及4个氨基酸(氨基酸2083和氨基酸3674 3676)中的2个缺失。在ORF1b中，该变体包含两个替换(P314L和I1566V)。此外，在ORF9b中，27 29号位点有P10S取代和三个残基缺失。结构蛋白E中有1个取代基(T9I)， M中有3个取代基(D3G、Q19E和A63T)， N中有3个取代基和3个残基缺失。虽然上述的突变出现在整个病毒基因组中，但剩下的占已识别的Omicron总突变的一半以上的突变是在峰值中积累的。这包括A67V, T95I, Y145D, L212I, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F的30个取代，H69/V70, G142/V143/Y144和N211的3个缺失，在214位插入3个氨基酸(EPE)(部分报道称V143/Y144/Y145与G142D结合缺失，以及与N211I结合缺失L212)。与其他4个VOC变异相比，Omicron中发现的spike突变的数量约为3 -4倍(图3)。
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