Aspera的下载与安装使用

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Aspera的下载安装使⽤
关于速铂Aspera
速铂Aspera是⼀套商业的⾼速⽂件传输解决⽅案,随着⾼通量数据的⼤量产⽣,从⽽对于⼤⽂件快速传输的需求,开始应⽤到⽣物领域,⽬前NCBI、EBI的SRA库都提供这样的服务。
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传统的FTP、HTTP等数据传输协议都是基于TCP的,TCP在远距离数据传输中存在⼀些先天的不⾜,⽂件越⼤、距离越远,其丢包、延时等问题对于传输速度的影响就越⼤。速铂Aspera通过应⽤了⼀个名为fasp™ 的底层技术,替换了传统的TCP传输协议。它彻底克服了TCP 固有瓶颈,实现了在各种共享和私有⽹络环境中传输速度的最⼤化。这种技术可以获得完美的传输效率,不为⽹络延迟和丢包所限制。并且,⽤户享有对传输速度以及不同传输流之间带宽共享的⽆以伦⽐的控制。不管⽹络距离和动态性能如何,即便是在最困难的⽹络条件下(例如卫星,⽆线和洲际远程链接),⽂件传输时间仍然可以得到保障。FASP具有内置的,完整的安全性,包括连接节点安全验证,传输中数据加密以及数据完整性验证。与FTP传输相⽐快了3-184倍。它可以灵活地部署在C/S 或B/S构架的应⽤上,并利⽤普通的IP⽹络最⼤限度地利⽤带宽进⾏⾼效传输。同时,它也有着极好的跨平台性,⽀持⼏乎所有的主要操作系统。该软件同时也 包含⼀种⽂件接⼒技术,使得在传输⼤量极⼩⽂件时,其效率与传输单个⼤尺⼨⽂件有着相同的效率与速度。
⼀句话,远距离,⼤⽂件,Aspera优势巨⼤。
客户端的下载与安装
即便Aspera是商业软件,但是作为客户应⽤⽅(相对于NCBI),我们使⽤其客户对进⾏数据的上传与下载是不⽤⽀付费⽤的。
安装,windows下直接双击,下⼀步,安装,注意安装⽬录有别与常规软件,安装⽬录为C:\Users\
[usename]\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect。linux下
led发光棒
sh aspera-connect-xx-linux-64.sh
浏览器下使⽤Aspera下载SRA数据(win 7)
开始菜单中,点击Aspera Connect,注意没有窗⼝显⽰,但是在右下⾓的运⾏程序的托盘中,会增加Aspera Connect的图标。
Aspera icon
链接配置,右击图标点击Preferences,选择Networks选项卡,配置⽹络连接类型或者速度限制
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Aspera Connect Configuration
1000genomes
在aspera的Transfers窗⼝,就可以看见下载了电汽锅
使⽤ascp下载SRA数据
ascp是Aspera Connect的命令⾏程序。
相关的参数
–Q (for adaptive flow control) – needed for disk throttling!
–T to disable encryption
–k1 enable resume of failed transfers
–l (maximum bandwidth of request, try 200M and go up from there)
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–r recursive copy
–i
命令格式
ascp -i -k1 -QTr –l200m
bi.v:/
命令⽰例:
ascp -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.putty -Q -l100m bi.v:/1GB .
汽结构
ascp -i ucdbioinfo.ppk -QTr -l 300M bi.v:incoming/
ascp -QT -l640M -i "/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources/asperaweb_id_dsa.putty" bi.v:1GB /tmp/
ascp -QT -l640M -i /opt/aspera/etc/asperaweb_id_dsa.putty bi.v:1GB /tmp/
提供Aspera的数据库
NCBI的Sequence Read Archive (SRA), dbGaP, .
1000genomes – EBI Aspera site, the NCBI Aspera site
参考
Aspera Transfer Guide
Using Aspera Connect Software for NCBI Data Downloads
Aspera upload/download to NCBI

本文发布于:2023-05-15 16:24:14,感谢您对本站的认可!

本文链接:https://patent.en369.cn/patent/2/100530.html

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标签:传输   数据   安装   下载   传输速度   配置
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