一种结构化报告生成方法、系统及存储介质

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著录项
  • CN202210738118.9
  • 20220627
  • CN115295111A
  • 20221104
  • 复旦大学附属中山医院厦门医院;北京赛迈特锐医疗科技有限公司
  • 王学理;林炜峰;周建军;岳新;贺长征;张虽虽
  • G16H15/00
  • G16H15/00 G16H10/60 G16H50/20 G16H50/70 G06K9/62 G06F40/18

  • 福建省厦门市湖里区金湖路668号
  • 福建(35)
  • 厦门仕诚联合知识产权代理事务所(普通合伙)
  • 陈蓓蓓
摘要
本发明公开了一种结构化报告生成方法、系统及存储介质,其包括:以下步骤:步骤a.获取临床信息数据,临床信息数据至少包括临床检查申请数据;步骤b.根据临床检查申请数据内容,进行标签化处理,得到标签化数据;标签化处理包括编码处理、标签化;步骤c.根据标签化数据,获取对应的结构化报告模板,所述结构化报告模板内包括预设标签,将标签化数据与预设标签进行自动匹配;步骤d.根据自动匹配结果,将临床检查申请数据展现并保存到预设标签的对应控件中,生成结构化报告。本发明实现了影像报告系统与临床系统的互动,形成了结构化报告,能够将临床信息作为后期的大数据分析基础,提高了日常医疗诊断、临床科研工作的效率。
权利要求

1.一种结构化报告生成方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤a.获取临床信息数据,临床信息数据至少包括临床检查申请数据;

步骤b.根据临床检查申请数据内容,进行标签化处理,得到标签化数据;所述标签化处理包括编码处理、标签化;

步骤c.根据标签化数据,获取对应的结构化报告模板,所述结构化报告模板内包括预设标签,将标签化数据与预设标签进行自动匹配;

步骤d.根据自动匹配结果,将临床检查申请数据展现并保存到预设标签的对应控件中,生成结构化报告。

2.根据权利要求1所述的一种结构化报告生成方法,其特征在于:所述临床信息数据在临床信息录入平台生成,具体生成步骤如下:

获取临床信息数据,并下发临床检查申请数据保存通知;所述临床检查申请数据保存通知至少包括预设保存方式、预设保存时间;所述预设保存方式包括以结构化形式保存或以非结构化形式保存;所述预设保存时间为开始填写检查申请时至完成检查申请填写前中的任一时刻;

根据临床检查申请数据保存通知,将临床检查申请数据保存于临床信息录入平台。

3.根据权利要求2所述的一种结构化报告生成方法,其特征在于:当预设保存方式为结构化形式保存时,所述临床检查申请数据保存通知还包括结构化表格获取入口;

当预设保存方式为非结构化形式保存时,所述临床检查申请数据保存通知还包括临床检查申请数据填写区域。

4.根据权利要求2所述的一种结构化报告生成方法,其特征在于:所述临床信息录入平台内设置有不同的医疗场景,将临床检查申请数据保存于临床信息录入平台时,自动建立临床检查申请数据与对应医疗场景的关联关系;

所述临床检查申请数据至少包括检查项目、检查申请目的。

5.根据权利要求1所述的一种结构化报告生成方法,其特征在于:步骤a中,具体是通过HL7或Webservice接口方式获取临床信息数据,并且根据不同的检查项目,设置有对应的扩展字段。

6.根据权利要求5所述的一种结构化报告生成方法,其特征在于:步骤b中标签化处理是根据HL7的消息字段定义或Webservice消息的XML节点定义,对临床检查申请数据进行标签化处理。

7.根据权利要求6所述的一种结构化报告生成方法,其特征在于:标签化处理具体包括如下步骤:

获取预设编码定义;

根据预设编码定义对临床检查申请数据内容进行编码处理;所述编码处理具体为,将临床检查申请数据内容中字段的值与预设编码定义进行匹配;

基于匹配结果,进行标签化;所述标签化具体为将编码处理结果进行分类。

8.根据权利要求7所述的一种结构化报告生成方法,其特征在于:所述预设编码定义至少包括Radlex编码或系统自定义编码。

9.一种结构化报告生成系统,其特征在于,包括:

数据接口模块,获取临床信息数据,临床信息数据至少包括临床检查申请数据;

标签化处理模块,用于根据临床检查申请数据内容,进行标签化处理,得到标签化数据;所述标签化处理包括编码处理、标签化;

数据匹配模块,用于根据标签化数据,获取对应的结构化报告模板,所述结构化报告模板内包括预设标签,将标签化数据与预设标签进行自动匹配;

展现与保存模块,用于根据自动匹配结果,将临床检查申请数据展现并保存到预设标签的对应控件中,生成结构化报告。

10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质上存储有结构化报告生成程序,所述结构化报告生成程序被处理器执行时实现如权利要求1至8任一项所述的结构化报告生成方法的步骤。

说明书
技术领域

本发明涉及医疗信息领域,特别是一种结构化报告生成方法及其应用该方法的结构化报告生成系统、计算机可读存储介质。

临床申请系统,能够根据患者的症状,推荐医护人员记录患者的症状相关信息,例如参数值类型;以及能够根据患者的症状,推荐患者需要做哪些检查。

目前,国内外有部分医疗机构开发了个性化的临床申请系统,系统除了涵盖常规的检查申请信息(如:临床诊断、检查目的、患者症状等)外;还可以根据检查类型、申请项目、申请目的等信息收集有助于影像检查的临床数据。

但是,对于上述数据的查看/展示方式只能通过医护人员自行进行人工查,无法形成结构化报告进行展现和保存,使得上述数据无法作为后期的大数据分析基础,导致日常医疗诊断、临床科研工作的效率较低。

本发明的主要目的在于提供了一种结构化报告生成方法、系统及存储介质,旨在解决现有技术无法形成结构化报告,使得有助于影像检查的临床数据无法作为后期的大数据分析基础,导致日常医疗诊断、临床科研工作的效率较低的技术问题。

为实现上述目的,本发明提供了一种结构化报告生成方法,其包括以下步骤:步骤a.获取临床信息数据,临床信息数据至少包括临床检查申请数据;步骤b.根据临床检查申请数据内容,进行标签化处理,得到标签化数据;所述标签化处理包括编码处理、标签化;步骤c.根据标签化数据,获取对应的结构化报告模板,所述结构化报告模板内包括预设标签,将标签化数据与预设标签进行自动匹配;步骤d.根据自动匹配结果,将临床检查申请数据展现并保存到预设标签的对应控件中,生成结构化报告。

可选的,所述临床信息数据在临床信息录入平台生成,具体生成步骤如下:获取临床信息数据,并下发临床检查申请数据保存通知;所述临床检查申请数据保存通知至少包括预设保存方式、预设保存时间;所述预设保存方式包括以结构化形式保存或以非结构化形式保存;所述预设保存时间为开始填写检查申请时至完成检查申请填写前中的任一时刻;根据临床检查申请数据保存通知,将临床检查申请数据保存于临床信息录入平台。

可选的,当预设保存方式为结构化形式保存时,所述临床检查申请数据保存通知还包括结构化表格获取入口;当预设保存方式为非结构化形式保存时,所述临床检查申请数据保存通知还包括临床检查申请数据填写区域。

可选的,所述临床信息录入平台内设置有不同的医疗场景,将临床检查申请数据保存于临床信息录入平台时,自动建立临床检查申请数据与对应医疗场景的关联关系;所述临床检查申请数据至少包括检查项目、检查申请目的。

可选的,步骤a中,具体是通过HL7或Webservice接口方式获取临床信息数据,并且根据不同的检查项目,设置有对应的扩展字段。

可选的,步骤b中标签化处理是根据HL7的消息字段定义或Webservice消息的XML节点定义,对临床检查申请数据进行标签化处理。

可选的,标签化处理具体包括如下步骤:获取预设编码定义;根据预设编码定义对临床检查申请数据内容进行编码处理;所述编码处理具体为,将临床检查申请数据内容中字段的值与预设编码定义进行匹配;基于匹配结果,进行标签化;所述标签化具体为将编码处理结果进行分类。

可选的,所述预设编码定义至少包括Radlex编码或系统自定义编码。

与所述结构化报告生成方法相对应的,本发明提供一种结构化报告生成系统,其包括:数据接口模块,获取临床信息数据,临床信息数据至少包括临床检查申请数据;标签化处理模块,用于根据临床检查申请数据内容,进行标签化处理,得到标签化数据;所述标签化处理包括编码处理、标签化;数据匹配模块,用于获取结构化报告模板,所述结构化报告模板内包括预设标签,将预设标签与标签化数据进行自动匹配;展现与保存模块,用于根据自动匹配结果,将临床检查申请数据展现并保存到预设标签的对应控件中,生成结构化报告。

此外,为实现上述目的,本发明还提供一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质上存储有结构化报告生成程序,所述结构化报告生成程序被处理器执行时实现如上文所述的结构化报告生成方法的步骤。

本发明的有益效果是:

(1)通过临床信息录入平台,使得临床医生(或者其他医护人员)在开具检查单时,能够即时录入该患者的临床检查申请数据,作为临床检查数据显示的基础,影像报告医生(或其他医护人员)在撰写影像分析报告的同时,影像报告系统能够直接调用结构化报告,自动显示该患者的临床检查数据,能够即时看到该患者的临床信息(检查目的、临床检查数据等),有助于影像医生撰写报告;并且,通过标签化处理以及将标签化数据与预设标签进行自动匹配,生成结构化报告并下发至影像报告系统,实现了影像报告系统与临床系统的互动,结构化报告能够将临床信息作为后期的大数据分析基础,提高了日常医疗诊断、临床科研工作的效率;

(2)通过临床检查申请数据保存通知,在临床医生(或其他医护人员)填写检查申请时,提醒其将临床检查申请数据填写到申请单中进行保存,实现了前瞻性的质控;相比于现有技术在申请结束后,再通过自然语言处理技术从不同的系统中提取信息,技术难度与技术成本都大大降低,更具有实操性意义;同时,也可帮助临床医生(或其他填写检查申请的医护人员)获取更多与该疾病相关的检查数据或开具新的检查申请。

(3)通过设置不同的保存形式,提高了临床检查申请数据保存的灵活性,有助于提高临床检查申请数据保存效率;

(4)通过自动建立临床检查申请数据与对应医疗场景的关联关系,能够通过现有的结构化数据查询分析系统,对临床检查申请数据进行查询分析;

(5)通过根据不同的检查项目设置对应的扩展字段,医院信息系统(HIS)/电子病历(EMR)系统可以将相关信息直接填写到扩展字段中;

(6)通过编码处理,在结构化系统内部以编码和值的关系进行数据存储,使得有助于影像检查的临床数据能够用于各种数据分析、接口的对接等。

此处所说明的附图用来提供对本发明的进一步理解,构成本发明的一部分,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。在附图中:

图1为本发明结构化报告生成方法的流程简图;

图2为本发明一实施例结构化表格示意图。

为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。应当理解,此处所描述的具体实施例仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。

如图1所示,本发明的一种结构化报告生成方法,其包括以下步骤:步骤a.获取临床信息数据,临床信息数据至少包括临床检查申请数据;步骤b.根据临床检查申请数据内容,进行标签化处理,得到标签化数据;所述标签化处理包括编码处理、标签化;步骤c.根据标签化数据,获取对应的结构化报告模板,所述结构化报告模板内包括预设标签,将标签化数据与预设标签进行自动匹配;步骤d.根据自动匹配结果,将临床检查申请数据展现并保存到预设标签的对应控件中,生成结构化报告。

需要说明的是,本发明生成的结构化报告可以直接下发至影像报告系统,在用户撰写影像分析报告的同时,影像报告系统能够直接调用结构化报告,自动显示该患者的临床检查数据。

本发明通过临床信息录入平台,使得临床医生(或者其他医护人员)在开具检查单时,能够即时录入该患者的临床检查申请数据,作为临床检查数据显示的基础,影像报告医生(或其他医护人员)在撰写影像分析报告的同时,影像报告系统能够直接调用结构化报告,自动显示该患者的临床检查数据,能够即时看到该患者的临床信息(检查目的、临床检查数据等),有助于影像医生撰写报告;并且,通过标签化处理以及将标签化数据与预设标签进行自动匹配,生成结构化报告并下发至影像报告系统,实现了影像报告系统与临床系统的互动,结构化报告能够将临床信息作为后期的大数据分析基础,提高了日常医疗诊断、临床科研工作的效率。

在本实施例中,所述临床信息数据在临床信息录入平台生成,具体生成步骤如下:获取临床信息数据,并下发临床检查申请数据保存通知;临床检查申请数据保存通知至少包括预设保存方式、预设保存时间;预设保存方式包括以结构化形式保存或以非结构化形式保存;预设保存时间为开始填写检查申请时至完成检查申请填写前中的任一时刻;根据临床检查申请数据保存通知,将临床检查申请数据保存于临床信息录入平台。即,在预设保存时间内,将临床检查申请数据以预设保存方式进行保存。

在本实施例中,步骤a具体为从临床信息录入平台获取临床信息数据。

具体而言,当预设保存方式为结构化形式保存时,临床检查申请数据保存通知还包括结构化表格获取入口;通过该入口医护人员可以直接获取结构化表格,在该表格模板内进行临床申请数据填写,具体可参考图2;当预设保存方式为非结构化形式保存时,临床检查申请数据保存通知还包括临床检查申请数据填写区域。

本发明通过临床检查申请数据保存通知,在临床医生(或其他医护人员)填写检查申请时,提醒其将临床检查申请数据填写到申请单中进行保存,实现了前瞻性的质控;相比于现有技术在申请结束后,再通过自然语言处理技术从不同的系统中提取信息,技术难度与技术成本都大大降低,更具有实操性意义;同时,也可帮助临床医生(或其他填写检查申请的医护人员)获取更多与该疾病相关的检查数据或开具新的检查申请。

例如,病人需要申请因肺癌可能的“胸部CT平扫”检查项目时,则临床信息录入平台界面获取临床信息数据,提示关于肺部炎症程度的各种信息,并下发临床检查申请数据保存通知,提醒医护人员填写如下数据并存储数据如下表1所示:

编码 说明 值 Redlex:0001,Redlex:1001 吸烟每年包 50 Redlex:0001,Redlex:1002 当前吸烟情况 已戒烟 Redlex:0001,Redlex:1002 戒烟时间 1年 Redlex:0001,Redlex:1002 第一次肺部穿刺时间 有 … … …

表1

并且,本发明通过设置不同的保存形式,提高了临床检查申请数据保存的灵活性,有助于提高临床检查申请数据保存效率。

在本实施例中,临床信息录入平台内设置有不同的医疗场景,将临床检查申请数据保存于临床信息录入平台时,自动建立临床检查申请数据与对应医疗场景的关联关系;临床检查申请数据至少包括检查项目、检查申请目的。

本发明通过自动建立临床检查申请数据与对应医疗场景的关联关系,能够通过现有的结构化数据查询分析系统,对临床检查申请数据进行查询分析。

在本实施例中,步骤a中,具体是通过HL7或Webservice接口方式获取临床信息数据,并且根据不同的检查项目,设置有对应的扩展字段。

例如,对于“胸部CT平扫”检查项目,可设置“检查目的”、“吸烟史”、“工作环境”等对应的扩展字段,进一步地,对于“检查目的”还可以设置“肺癌分期”、“胸痛咳痰”等扩展字段;对于“吸烟史”,进一步设置“吸烟时长”、“是否戒烟”等扩展字段,“已戒烟”可进一步设置“已戒时长”扩展字段。

本发明通过根据不同的检查项目设置对应的扩展字段,打破了常规的接口交互的信息字段都是固定的局限性,医院信息系统(HIS)/电子病历(EMR)系统可以将相关信息直接填写到扩展字段中。

进一步而言,步骤b中标签化处理是根据HL7的消息字段定义或Webservice消息的XML节点定义,对临床检查申请数据进行标签化处理。

在本实施例中,若HL7消息当中传输的是短语,那么也可以根据字段的编码调用相应的NLP(Natural Language Processing,自然语言处理)技术提取模型来准确获取相关标签化数据。对于该语义学内涵狭窄、几乎没有语法的场景下,NLP技术准确提取信息的代价较为可控。

在本实施例中,标签化处理具体包括如下步骤:获取预设编码定义;根据预设编码定义对临床检查申请数据内容进行编码处理;所述编码处理具体为,将临床检查申请数据内容中字段的值与预设编码定义进行匹配;基于匹配结果,进行标签化;所述标签化具体为将编码处理结果进行分类。

优选的,预设编码定义至少包括Radlex编码或系统自定义编码。Radlex为放射科医学术语标准。例如,根据Radlex编码将以下“胸部CT平扫”数据进行标签化处理具体为:

1、检查目的(radlex:172010-编码)

①肺癌分期(radlex:172011-编码;该编码对应的值为:肺癌分期,该值对应的标签化分类为“检查目的”)

②胸痛咳痰(radlex:172012-编码;该编码对应的值为:胸痛咳痰,该值对应的标签化分类为“检查目的”)

③等(radlex:172013-编码)

2、吸烟史(radlex:172020-编码)

①吸烟时长(radlex:172021-编码;该编码对应的值为:吸烟时长,该值对应的标签化分类为“吸烟史”)

②是否戒烟(radlex:172022-编码;该编码对应的值为:是否戒烟,该值对应的标签化分类为“吸烟史”)

A.已戒时长(radlex:172022-编码,radlex:172022-1-编码)

3、工作环境(radlex:172030-编码)

需要说明的是,上述“检查目的”、“吸烟史”、“工作环境”即标签,标签化处理主要是对编码化对应的值进行分类。

对于编码处理后的数据,再按照此树的格式,定义到xml中。

需要说明的是,对于无Radlex编码的某项字段,则根据系统自定义编码进行编码处理。

本发明通过编码处理,在结构化系统内部以编码和值的关系进行数据存储,使得有助于影像检查的临床数据能够用于各种数据分析、接口的对接等。

与结构化报告生成方法相对应的,本发明提供一种结构化报告生成系统,其包括:数据接口模块,获取临床信息数据,临床信息数据至少包括临床检查申请数据;标签化处理模块,用于根据临床检查申请数据内容,进行标签化处理,得到标签化数据;所述标签化处理包括编码处理、标签化;数据匹配模块,用于获取结构化报告模板,结构化报告模板内包括预设标签,将预设标签与标签化数据进行自动匹配;展现与保存模块,用于根据自动匹配结果,将临床检查申请数据展现并保存到预设标签的对应控件中,生成结构化报告。

本发明提供一种结构化报告生成系统,还包括编码化处理模块,用于获取预设编码定义,并对标签化处理后的临床检查申请数据进行编码处理。

此外,为实现上述目的,本发明还提供一种计算机可读存储介质,计算机可读存储介质上存储有结构化报告生成程序,结构化报告生成程序被处理器执行时实现如上文的结构化报告生成方法的步骤。该计算机可读存储介质中存储有至少一条指令,所述指令由处理器加载并执行以实现图1所示的结构化报告生成方法。所述计算机可读存储介质可以是只读存储器,磁盘或光盘等。

需要说明的是,本说明书中的各个实施例均采用递进的方式描述,每个实施例重点说明的都是与其他实施例的不同之处,各个实施例之间相同相似的部分互相参见即可。对于装置实施例、设备实施例及存储介质实施例而言,由于其与方法实施例基本相似,所以描述的比较简单,相关之处参见方法实施例的部分说明即可。

并且,在本文中,术语“包括”、“包含”或者其任何其他变体意在涵盖非排他性的包含,从而使得包括一系列要素的过程、方法、物品或者设备不仅包括那些要素,而且还包括没有明确列出的其他要素,或者是还包括为这种过程、方法、物品或者设备所固有的要素。在没有更多限制的情况下,由语句“包括一个……”限定的要素,并不排除在包括所述要素的过程、方法、物品或者设备中还存在另外的相同要素。

上述说明示出并描述了本发明的优选实施例,应当理解本发明并非局限于本文所披露的形式,不应看作是对其他实施例的排除,而可用于各种其他组合、修改和环境,并能够在本文发明构想范围内,通过上述教导或相关领域的技术或知识进行改动。而本领域人员所进行的改动和变化不脱离本发明的精神和范围,则都应在本发明所附权利要求的保护范围内。

本文发布于:2023-04-14 01:23:40,感谢您对本站的认可!

本文链接:https://patent.en369.cn/patent/1/86865.html

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